Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Gm5460Q3UQ97 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5460Q3UQ97 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms