Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms