Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp19Q3UJD6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp19Q3UJD6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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