Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms