Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms