Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
F13bQ07968 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
F13bQ07968 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms