Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gdf3Q07104 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms