Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 AV039307-201ENSMUST00000124795 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Siah2Q06986 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms