Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Cited1P97769 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Cited1P97769 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Cited1P97769 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Cited1P97769 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Cited1P97769 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Cited1P97769 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cited1P97769 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms