Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx2P81066 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms