Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NficP70255 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NficP70255 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms