Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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