Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1AP62821 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms