Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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