Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Cldn18P56857 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Cldn18P56857 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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