Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
AgrpP56473 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms