Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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LtbP41155 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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LtbP41155 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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LtbP41155 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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LtbP41155 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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LtbP41155 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LtbP41155 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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