Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp4P35123 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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