Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms