Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P20040 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P20040 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P20040 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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