Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18533 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18533 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18533 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms