Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P18530 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P18530 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms