Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms