Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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