Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajb6O54946 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajb6O54946 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajb6O54946 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajb6O54946 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajb6O54946 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajb6O54946 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Dnajb6O54946 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dnajb6O54946 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms