Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms