Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DffaO54786 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms