Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm20744-201ENSMUST00000208972 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pnisr-203ENSMUST00000108229 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AI182371-201ENSMUST00000045776 1724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm10364-201ENSMUST00000076633 1328 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nell2-201ENSMUST00000075275 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms