Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21976J3QNN2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21976J3QNN2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms