Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21060J3KMU4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms