Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Gm21818J3KMS6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21818J3KMS6 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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