Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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