Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms