Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm18640-201ENSMUST00000209777 2165 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Oprl1-202ENSMUST00000108763 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Stra6-214ENSMUST00000170397 3077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm1070-201ENSMUST00000114185 2874 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Pvt1-201ENSMUST00000180432 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dpp6-202ENSMUST00000101471 4491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gle1-201ENSMUST00000019859 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 A530076I17Rik-201ENSMUST00000138379 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-219ENSMUST00000122356 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Bcas1-202ENSMUST00000068137 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Chrdl2-202ENSMUST00000107084 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC126804.1-201ENSMUST00000216609 2079 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm18876-201ENSMUST00000219985 1849 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms