Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20671F6TVX7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm20671F6TVX7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm20671F6TVX7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20671F6TVX7 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms