Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms