Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms