Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms