Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Wdr54Q9R0D8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Wdr54Q9R0D8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Wdr54Q9R0D8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Wdr54Q9R0D8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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