Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms