Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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