Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms