Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpsap1Q9D0M1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms