Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smurf1Q9CUN6 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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