Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TpbpbQ9CQC0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms