Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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