Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms