Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms