Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dkk4Q8VEJ3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dkk4Q8VEJ3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms