Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms